玩家在游戏中设置某颗星球为母星后，将拥有对仓库的操作权限。且玩家战斗失败后将在自动返回母星。当玩家抵达新的星球后，可以通过“设为母星”更换母星。当玩家达到一定要求加入军团或者帝国后，玩家母星设置将自动跳转至当前军团或帝国的驻地或主星。

主角仓库分为物资仓库、战机仓库及船坞（战舰仓库），功能分别为道具存放、副官战机存放、角色战舰维修、存放。

物资仓库：物资仓库初始容量为12格，玩家可通过能量石扩充仓库容量。

战机仓库：在舰队配置界面中，玩家可查看购买的副官战机储量等相关信息。

船坞：为玩家提供战舰存放点，玩家船坞初始战舰存放上限为10艘。可通过VIP等级提升存放上限。同时，船坞提供战舰更换与维修服务